مطالعه روابط بین ساختار شیمیایی - خواص فیزیکی و فعالیت های بیولوژیکی به کمک کمومتریکس

پایان نامه
چکیده

بخش اول- رویکردهای ارتباط کمی ساختار- بازداری (qsrr) مبتنی بر اندیس های اتصال مولکولی برای پیش بینی اندیس های بازداری نسبی کواتس کروماتوگرافی گازی (gc-rri) 132 ترکیب آلی فرار بر روی 12 (4 تا غیرقطبی و 8 تا قطبی) فاز ساکن مختلف، (c67، c78، c103، c?، poh، tif، mtf، pcl، pbr، tmo، psh، pcn) در دمای ?130 مفید هستند. بهینه سازی هندسی کامل براساس روش نیمه تجربی اوربیتال مولکولی am1 انجام شد. مجموعه ای از 30 توصیف گر مولکولی مستقیماً از ساختارهای توپولوژیکی ترکیبات از برنامه dragon به دست آمدند. به وسیله روش انتخاب متغیر نهایی الگوریتم های رگرسیون مرحله به مرحله حذف گزینشی، سه توصیف گر بهینه برای توسعه مدل qsrr برای پیش بینی rriهای ترکیبات آلی بر روی هر فاز ساکن با ضریب همبستگی بین 9378/0 و 9673/0 و ضریب همبستگی ارزیابی تقاطعی یکی در بیرون بین 9325/0 و 9653/0 انتخاب شدند. خطاهای ریشه میانگین مربعات بر روی 12 فاز ساکن مختلف در گستره 0333/0 تا 0458/0 قرار دارند. به علاوه، صحت تمام مدل های توسعه یافته با استفاده از روش های تصادفی کردن-y ، ارزیابی خارجی از طریق زوج و فرد کردن و تقسیم سری داده های ورودی به سری های آموزشی و آزمایشی تأیید شد. تفسیر موفقی از روابط پیچیده بین gc-rri های ترکیبات آلی فرار و ساختارهای شیمیایی استفاده شده در روش های qsrr حاصل شده است. سه شاخص اتصالی در مدل ها به طور منطقی قابل تفسیرند، که نشان می-دهند rri های تمام ترکیبات آلی به طور دقیق با استفاده از شاخص های اتصال مولکولی ارائه می شود. کلمات کلیدی: رابطه کمی ساختار- بازداری، اندیس های بازداری کواتس، اندیس های اتصالی، الگوریتم های رگرسیون مرحله به مرحله حذف گزینشی. بخش دوم- مطابق رده های فرعی مشتقات فلاون، فلاونوئیدهای شناسایی شده در میوه های خانواده مرکبات بیش از 60 نوع از فلاونوئیدها را پوشش می دهند. از میان رده های فرعی فلاون ها، یک سری آنالوگ های پدید آمده به طور طبیعی یا سنتزی از فلاون های پلی متوکسیله در مطالعات زیادی نشان داده اند که عملکرد های ضدتکثیری قوی در مقابل تعدادی از سلول های سرطانی انسان از خود نشان می دهند. تجزیه و تحلیل روابط کمی ساختار- فعالیت (qsar) برای یک مجموعه هفده تایی از فلاونوئیدهای پلی متوکسیله در مقابل 6 نوع سلول های سرطانی انسان شامل ریه، پروستات، روده، پوست و سرطان سینه با گیرنده استروژن مثبت (er+) و گیرنده استروژن منفی (er-) جهت ایجاد روابط همبستگی و پیش بینی کردن فعالیت های ضدتکثیری (غلظت مهارکنندگی 50% یا 90% از واکنش آنزیم یا رشد سلول ic50 و ic90) انجام شده است. مدل سازی فعالیت های ضدتکثیری این ترکیبات به عنوان تابعی از توصیف-گرهای محاسبه شده تئوری با استفاده از آنالیز رگرسیون خطی چندگانه (mlra) ساخته شد. از الگوریتم ژنتیک (ga) برای انتخاب متغیرهای مورد استفاده در بهترین مدل های برازش شده استفاده شد. معادلات به دست آمده شامل توصیف گرهای مولکولی محاسبه شده بر مبنای ویژگی های ساختار مولکولی با استفاده از نرم افزار دراگون و روش های شیمی- کوانتومی می باشند. به وسیله روش انتخاب متغیر الگوریتم ژنتیک، تعدادی از توصیف گرهای مولکولی براساس روش انتخاب مرحله به مرحله برای هر کدام از انواع سلول های سرطانی انسانی به دست آمدند. کارآیی مدل qsar برای هر نوع سلول سرطان انسان به وسیله مقادیر r2 به دست آمده برای مدل اصلی بررسی شدند. هم چنین رفتار مدل ها در هر دو ic50 و ic90، با محاسبه پارامترهای آماری خطای اریب میانگین (mbe)، خطای مطلق میانگین (mae)، خطای ریشه میانگین مربعات (rmse) و شاخص توافق (d2 یا ia) ارزیابی شدند. کلمات کلیدی: فعالیت های ضدتکثیری؛ فلاونوئید؛ فلاون های پلی متوکسیله؛ qsar؛ مرکبات؛ سرطان؛ ریه؛ پروستات؛ سینه؛ روده؛ پوست.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

رابطه ساختار- فعالیت در برخی ترکیبات فسفرآمید

با استفاده از تکنیک QSAR در سال‌های اخیر روابط ریاضی بسیاری در ارتباط بین ساختار شیمیایی و فعالیت بیولوژیکی ترکیبات هم‌خانواده بدست آمده است. در این روش با انتخاب مولکول‌هایی با خواص الکترونی، فضایی و آبگریزی معین، تغییرات هدفداری در ساختار عمومی ترکیب مادر ایجاد می‌شود. با اندازه‌گیری خواص شیمی ـ فیزیکی و فعالیت بیولوژیکی (سمیت، فعالیت دارویی) و یا هر فعالیت بیولوژیکی دیگر، یک خانواده از مولکو...

متن کامل

ترکیبات شیمیایی و فعالیت های بیولوژیکی ژل رویال

ژل رویال ماده­ای غلیظ و کرم رنگ است که از غدد غذاساز زنبورعسل تولید می­شود .ژل رویال شامل مخلوطی از آب، قندها، چربی، پروتئین­ها، اسید امینه­های آزاد پرولین و لیزین، برخی آنزیم­ها از جمله گلوکز اکسیداز، فسفاتاز و کولین استراز، بیوپترین و نئوپترین (پروتئین­هایی با نقش کوآنزیمی)، 10 هیدورکسی-2- دسنوئیک اسید است. ژل رویال به دلیل کاربردهای زیادی که در پزشکی و دارویی دارد ، امروزه در دنیا به عنوان ی...

متن کامل

اثر بیوچار بر ویژگی‌های فیزیکی، شیمیایی و بیولوژیکی خاک

بیوچار نوعی ماده آلی غنی از کربن می­باشد که از سوزاندن مواد آلی در شرایط اکسیژن کم و یا بدون اکسیژن تولید می­شود.ویژگی­های فیزیکی و شیمیایی منحصربه­فرد بیوچار، آن را از سایر مواد آلی خاک متمایز می­سازد. افزودن بیوچار به خاک می­تواند باعث بهبود ویژگی­های فیزیکی خاکمانند افزایش سطح ویژه، ظرفیت نگهداری آب، تهویهو کاهش فرسایش خاک، شیمیایی مانند افزایش ظرفیت تبادل کاتیونی، pH، کربن آلی، فراهمی عناصر...

متن کامل

تاثیر آتش‎سوزی برخصوصیات فیزیکی، شیمیایی و بیولوژیکی خاک اکوسیستم‎های جنگلی

آتش‎سوزی یکی از رخدادهای مهم و رایج در کلیه اکوسیستم‎های جنگلی است که تاثیرات بسیار پیچیده‎ای بر روی خصوصیات خاک دارد. تغییرات در خصوصیات فیزیکی (تخریب ساختار و تخلخل خاک، افزایش رواناب و فرسایش)، شیمیایی (کاهش مواد آلی، تبخیر کاتیون‎ها، تغییر در ذخایر عناصر غذایی وچرخه آن‎ها) و بیولوژیکی خاک (کاهش در گونه‎های میکرو و ماکروفون‎ها و تغییر جمعیت میکربی) توسط آتش می‎تواند سبب تغییر در پوشش و فعالی...

متن کامل

بررسی ساختار و ویژگی های فیزیکی- شیمیایی پلیمرهای پایه چسب های حساس به فشار

اصطلاح چسب حساس به فشار معرف چسبهایی است که در حالت خشک و دمای معمولی با فشاردست و انگشت با اجسام پیوند قوی برقرار م یکنند. در مطالعه حاضر، ساختار انواع چسب هایحساس به فشار بررسی می شود. ترکیب پلیمرهای پایه چسب حساس به فشار شامل پلیمرهایآکریلیک، سیلیکون ها، پلی یورتان ها و پلی استرهاست. پلیمرهای آکریلیک چسب های حساس به فشاربر پایه آب، حلال های آلی یا عاری از حلال آلی هستند. پلیمرهای آکریلیک به ...

متن کامل

بررسی ارتباط کمی ساختار- فعالیت برخی ترکیبات شیمیایی بوسیله کمومتریکس

کاندیدیازیس عفونت ناشی از قارچ کاندیدا آلبیکانس است. مشتقات بتراکسازول ها، بنزایمیدازول ها و )4و5 – (b پیریدین اکسازول ها دارای اثر مهار کنندگی روی این قارچ هستند . در پژوهش حاضر در مرحله ی اول سعی شده است با استفاده از روش رگراسیون خطی چند گانه ، فعالیت بیولوژیکی این ترکیبات مدل سازی و پیش بینی شود . این مشتقات شامل 60 مولکول هستند ، که مقادیر تجربی مهار کنندگی انها در دسترس است .

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کردستان - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023